Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP0

Zfp708, Zinc finger protein 708, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp708F8VPP0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp708F8VPP0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp708F8VPP0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms