Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdh11xF6ZNL5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdh11xF6ZNL5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms