Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Igkv1-99F6XWB2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms