Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Crocc2F6XLV1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Crocc2F6XLV1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Crocc2F6XLV1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Crocc2F6XLV1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms