Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3072F6SKY8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms