Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prl3d2F6R3P9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prl3d2F6R3P9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms