Protein–RNA interactions for Protein: E9QAA8

Gm4841, Interferon-gamma-inducible GTPase Ifgga3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4841E9QAA8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm4841E9QAA8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4841E9QAA8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4841E9QAA8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms