Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A430078G23RikE9Q7Y4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A430078G23RikE9Q7Y4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms