Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Urb2E9Q7L1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Urb2E9Q7L1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Urb2E9Q7L1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms