Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Simc1E9Q6E9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Simc1E9Q6E9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Simc1E9Q6E9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Simc1E9Q6E9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms