Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srsf11E9Q6E5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf11E9Q6E5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms