Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85cE9Q6B2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85cE9Q6B2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms