Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FancfE9Q5Z5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FancfE9Q5Z5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FancfE9Q5Z5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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