Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930579F01RikE9Q3L6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms