Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NebE9Q1W3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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