Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm3893E9Q1I1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm3893E9Q1I1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3893E9Q1I1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms