Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930426L09RikE9Q0N7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms