Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm3095E9Q058 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3095E9Q058 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3095E9Q058 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms