Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Fndc1E9Q043 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Fndc1E9Q043 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Fndc1E9Q043 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms