Protein–RNA interactions for Protein: E9PYF4

Lmo7, LIM domain only 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo7E9PYF4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Lmo7E9PYF4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Lmo7E9PYF4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmo7E9PYF4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms