Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc62E9PVD1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc62E9PVD1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc62E9PVD1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms