Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifit3bE9PV48 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms