Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl3E0CZ16 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl3E0CZ16 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl3E0CZ16 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl3E0CZ16 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl3E0CZ16 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl3E0CZ16 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl3E0CZ16 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl3E0CZ16 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl3E0CZ16 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl3E0CZ16 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl3E0CZ16 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl3E0CZ16 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl3E0CZ16 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms