Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
4930407I10RikD3Z5T8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
4930407I10RikD3Z5T8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
4930407I10RikD3Z5T8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
4930407I10RikD3Z5T8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
4930407I10RikD3Z5T8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
4930407I10RikD3Z5T8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
4930407I10RikD3Z5T8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
4930407I10RikD3Z5T8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
4930407I10RikD3Z5T8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms