Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
5430403G16RikD3Z5L4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5430403G16RikD3Z5L4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
5430403G16RikD3Z5L4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5430403G16RikD3Z5L4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
5430403G16RikD3Z5L4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 555.2 ms