Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 827.3 ms