Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
3425401B19RikD3Z1D3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
3425401B19RikD3Z1D3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
3425401B19RikD3Z1D3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms