Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc170D3YXL0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc170D3YXL0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms