Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700015F17RikD3YUK8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700015F17RikD3YUK8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms