Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap58B2RW38 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap58B2RW38 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cfap58B2RW38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms