Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AU015836B2RUM3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AU015836B2RUM3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms