Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfx1B1AY10 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nfx1B1AY10 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfx1B1AY10 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms