Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3aB1AWZ3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms