Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2B1AVH7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tbc1d2B1AVH7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms