Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grik3B1AS29 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms