Protein–RNA interactions for Protein: A6H5Y3

Mtr, Methionine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrA6H5Y3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MtrA6H5Y3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MtrA6H5Y3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MtrA6H5Y3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms