Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al1jA2BFR3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2al1jA2BFR3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2al1jA2BFR3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms