Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramef17A2ASJ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef17A2ASJ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms