Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Patl2A2ARM1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Patl2A2ARM1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms