Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rtf1A2AQ19 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtf1A2AQ19 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtf1A2AQ19 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms