Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn1aA2APX8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.6 ms