Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
AI481877A2ALV5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
AI481877A2ALV5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
AI481877A2ALV5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
AI481877A2ALV5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms