Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FocadA2AKG8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FocadA2AKG8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FocadA2AKG8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms