Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VirmaA2AIV2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VirmaA2AIV2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VirmaA2AIV2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VirmaA2AIV2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
VirmaA2AIV2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VirmaA2AIV2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VirmaA2AIV2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VirmaA2AIV2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VirmaA2AIV2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VirmaA2AIV2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VirmaA2AIV2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VirmaA2AIV2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms