Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ambra1A2AH22 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ambra1A2AH22 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms