Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc163A2AGD7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc163A2AGD7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms