Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhbdl2A2AGA4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhbdl2A2AGA4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms