Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp8nlA2ABX0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp8nlA2ABX0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms