Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisal2aA2A9G7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisal2aA2A9G7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms