Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef6A2A8M8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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